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天津工业生物所开展“Rxnfinder细胞工厂设计技术”理论与上机培训
  发布时间:2015-07-15    供稿部门:胡黔楠研究组

  710日上午,天津工业生物技术研究所胡黔楠研究组联合国内多家单位开展了“Rxnfinder细胞工厂设计技术理论与上机培训课程。 

  培训期间,胡黔楠研究员首先对细胞工厂设计技术作了宏观的概括,对Rxnfinder设计中运用的一些基本方法,如分子结构smiles、生物合成反应smirks描述方法,生物合成反应搜索引擎方法,基于反应转化的酶的发现方法,途径设计方法以及和生物合成潜力挖掘方法,作了详尽的介绍,让参训人员对细胞工厂设计和Rxnfinder的基本原理有了一个整体的认识。随后,武汉大学细胞设计团队成员涂伟忠又针对生物合成反应搜索进行了专门的上机操作培训,帮助参训人员将理论应用于实践,进一步掌握了Rxnfinder的使用方法。通过本次培训,参训人员了解并掌握了Rxnfinder的使用,为其进一步的科研工作的开展提供了多方位的信息化指导。 

  Rxnfinder由胡黔楠研究组自主构建,是微生物细胞工厂设计的首选,拟打造成为生物合成领域的SciFinder 。数据库集成了50000条生物合成反应,覆盖了10多万篇生物合成文献,是一个多角度的生物合成信息化工具。Rxnfinder可以对生物合成途径进行交互式设计,挖掘化合物生物合成的潜力,实现一站式微生物细胞工厂设计。 

  Rxnfinder链接 

培训现场 

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