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天津工生所对Alicyclobacillus hesperidum全基因组测序获得进展
  发布时间:2012-03-06    供稿部门:

普鲁兰酶对于以淀粉为原料的食品加工以及生物能源等工业具有重要的作用。天津工业生物技术研究所基因工程与微生物应用技术组从云南轮马热泉下游淤泥中筛选得到一株耐热普鲁兰酶高产菌株Alicyclobacillus hesperidum。随着新一代测序技术的发展,完成菌株的理性改造从而提高产量以及酶学性质,并且获得更多产酶机理等相关重要信息,全基因组的测序提供了一条简单快捷的途径。

天津工业生物技术研究所陈祖耕研究员领导的基因分析实验室应用最先进的solexa paired-end 2x76b测序技术,对该耐热普鲁兰酶高产株Alicyclobacillus hesperidum进行全基因组测序,产生160x覆盖率的数据。应用Velvet拼接,得到130个contigs,并完成了初步的基因组注释,找到约1800个编码蛋白基因。

此项研究有助于了解Alicyclobacillus hesperidum高温普鲁兰酶产生机理,并发现高温生长所需的基因簇等重要信息。

现在中国核心期刊《微生物学报》发表综述文章:

论文连接:http://journals.im.ac.cn/actamicrocn/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=1106-3&flag=1

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