生物设计中心

团队简介

生物设计中心是2019年底研究所整合多个计算为主的研究组建立的交叉学科研究中心。中心愿景和长远目标是推动理论模型成为新生物学的核心,使计算设计成为生物技术研发的中枢,通过IT+AI+BT结合开发解决生物学问题的新算法新工具,培养新一代干法生物学家,与生物铸造厂无缝衔接颠覆现有工业生物技术开发模式。 围绕这一目标生物设计中心以工业生物大数据为基础,开发核心数据库、数学模型、设计算法及软件工具,实现酶等生物元件、代谢转化途径和细胞工厂的精准设计。生物设计中心代管研究所的高性能智算平台,为所内外提供算力和软件工具部署维护服务。承担生物制造数据中心建设任务,负责工业酶和工业菌种相关数据的汇交管理和分析系统开发...

团队负责人/执行主任

马红武现任中国科学院天津工业生物技术研究所研究员,生物设计中心主任。天津大学化工学院生物化工专业博士。曾分别在德国生物技术中心(GBF)和英国爱丁堡大学信息学院从事研究工作,2011年底回国。2019年组建生物设计中心并任主任。在包括Science, Nucleic Acids Research, Nature Communication,Metabolic Engineering等高水平刊物发表文章100余篇,引用约4000次。获得汤森路透计算机科学领域高被引科学家奖,天津市自然科学奖特等奖及二等奖。曾兼任中国生物工程学会生物资源专业委员会副主任委员和中科院系统微生物技术重点实验室副主任。现任中国生物学信息学会(筹)计算合成生物学专业委员会委员,Biodesign Research副主编...

研究方向与内容 更多+

1. 酶、生物传感器等生物元件的人工智能功能预测和设计及相关工具网站开发; 2. 代谢网络模型、多约束细胞模型及全细胞模型的构建分析; 3. 生物产品合成途径的设计及代谢工程菌种改造靶点预测方法和工具的开发和应用; 4. 高性能计算集群管理及软件系统开发,数据库、人工智能大模型、分析设计算法的部署应用; 5. 生物制造数据中心建设和相关数据汇交管理系统开发,酶和工业菌种相关数据库知识库的建设。

代表性成果 更多+

​(1)菌种知识库和高精度细胞模型构建; (2)代谢途径和菌种代谢工程改造策略设计; (3)基于结构机理和人工智能的酶功能预测和挖掘设计。

科研项目 更多+

团队承担了国家重点研发计划合成生物学专项、绿色生物制造专项。国家自然科学基金系列青年基金项目、中国科学院战略性先导科技专项、天津市合成生物技术创新能力提升行动,中国科学院重点部署,中国科学院青促会,中国科学院对外合作重点项目,JG项目以及企业委托等各类科研任务。

团队成员 更多+

  • 于静(博士后)
  • 杨毅(博士后)
  • 刘翠(助理研究员)
  • 蔡敬一(助理研究员)
  • 陈阳(工程师)
  • 李浩然(工程师)
  • 王若宇(工程师)
  • 关吉润(研究实习员)
  • 伍朋(研究实习员)
  • 邓小桂(助理工程师)
  • 杨春贺(助理工程师)
  • 魏凡(统招博士)
  • 李洋(统招硕士)
  • 赵玉玲(统招硕士)
  • 王德行(联培硕士)
  • 许雯淇(联培硕士)
  • 陈浩(联培硕士)
  • 李澳男(联培硕士)
  • 刘宇硕(联培硕士)
  • 孟庆涵(孟庆涵)
  • 齐轩(联培硕士)