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  副研究员
 
姓名  
刘岯
性别  
专家类别  
N/A
职称  
高级研发人员
学历  
博士研究生
电话  
N/A
传真  
N/A
电子邮件  
liu_p@tib.cas.cn
地址  
天津市空港经济区西七道32号
邮编  
300308

简历

2005-09 至 2011-06, 元素有机化学国家重点实验室, 农药学, 博士

2002-09 至 2005-06, 元素有机化学国家重点实验室, 农药学, 硕士

1998-09 至 2002-06, 南开大学化学学院, 化学, 学士

2012-09 至 2015-08, 南开大学生命科学学院, 药物设计,博士后

2015-11 至今,       中国科学院天津工业生物技术研究所, 酶设计


研究方向:
  

1. 酶的理性设计:采用分子动力学,量子化学,机器学习等方法,对酶的催化活性,结构稳定性,底物选择性,辅酶依赖性进行理性设计改造。

2. 生物探针设计:通过对转录调控因子的底物结合腔以及弹性网络进行设计改造,开发针对特定化合物的生物探针。

3. 生物合成途径设计:采用有机合成中的逆合成思路结合深度学习算法构建全新的生物合成途径。


承担科研项目情况:
  

(1)中国科学院,中国科学院稳定支持基础研究领域青年团队计划,YSBR0722,人工高性能甲醛缩合酶的设计与构建2022-7 至 2026-6,在研,主持

(2) 中国科学院, 国家任务/国家重点研发计划, Y9B44101, 生物元件适配性的评估与改造方法研究, 2019-07 至 2024-06, 在研, 主持

(3)天津市科技局, 地方任务/地方科技攻关计划课题, Y9M02902, 谷氨酸棒杆菌代谢工程改造策略设计, 2019-10 至 2023-10, 在研, 参与

(4)天津市科技局, 地方任务/地方科技攻关计划课题, Y9M02901, 生物计算与设计平台, 2019-10 至 2023-10, 在研, 参与

(5)天津市科技局, 地方任务/地方科技攻关计划课题, E0M02901, 生物设计核心能力与基础设施建设, 2019-10 至 2023-10, 在研, 参与

(6)天津市科技局, 地方任务/地方科技攻关计划课题, E1M02901, 生物合成途径关键元件的挖掘、设计和 改造, 2021-08 至 2022-12, 在研, 主持

(7)天津市科技局, 地方任务/地方科技攻关计划课题, E1M02902, 磷酸酶的理性设计与改造, 2022-01 至 2022-12, 在研, 主持


获奖及荣誉:
  


代表论著:

(1)   Shi, L.; Liu, P.; Tan, Z.; Zhao, W.; Gao, J.; Gu, Q.; Ma, H.; Liu, H.; Zhu, L. Complete Depolymerization of PET Wastes by an Evolved PET Hydrolase from Directed Evolution. Angew. Chemie - Int. Ed. 2023, 62 (14). https://doi.org/10.1002/anie.202218390.

(2)   Zhang, T.; Liu, P.; Wei, H.; Sun, X.; Zeng, Y.; Zhang, X.; Cai, Y.; Cui, M.; Ma, H.; Liu, W.; others. Protein Engineering of Glucosylglycerol Phosphorylase Facilitating Efficient and Highly Regio-and Stereoselective Glycosylation of Polyols in a Synthetic System. ACS Catal. 2022, 12, 15715–15727.

(3)   Nie, Z.; Liu, P.; Wang, Y.; Guo, X.; Tan, Z.; Shen, J.; Tang, Z.; Lin, J.; Sun, J.; Zheng, P.; Zhu, L. Directed Evolution and Rational Design of Mechanosensitive Channel MscCG2 for Improved Glutamate Excretion Efficiency. J. Agric. Food Chem. 2021, 69 (51), 15660–15669. https://doi.org/10.1021/acs.jafc.1c07086.

(4)   Zhang, P.; Liu, X.; Liu, P.; Wang, F.; Ariyama, H.; Ando, T.; Lin, J.; Wang, L.; Hu, J.; Li, B.; Fan, C. Capturing Transient Antibody Conformations with DNA Origami Epitopes. Nat. Commun. 2020, 11 (1), 1–9. https://doi.org/10.1038/s41467-020-16949-4.

(5)   Cheng, C.; Haider, J.; Liu, P.; Yang, J.; Tan, Z.; Huang, T.; Lin, J.; Jiang, M.; Liu, H.; Zhu, L. Engineered LPMO Significantly Boosting Cellulase-Catalyzed Depolymerization of Cellulose. J. Agric. Food Chem. 2020, 68 (51), 15257–15266. https://doi.org/10.1021/acs.jafc.0c05979.

(6)   Liu, X.; Jing, X.; Liu, P.; Pan, M.; Liu, Z.; Dai, X.; Lin, J.; Li, Q.; Wang, F.; Yang, S.; Wang, L.; Fan, C. DNA Framework-Encoded Mineralization of Calcium Phosphate. Chem 2020, 6 (2), 472–485. https://doi.org/10.1016/j.chempr.2019.12.003.

(7)   Liu, X.; Zhao, Y.; Liu, P.; Wang, L.; Lin, J.; Fan, C. Biomimetic DNA Nanotubes: Nanoscale Channel Design and Applications. Angew. Chemie - Int. Ed. 2019, 58 (27), 8996–9011. https://doi.org/10.1002/anie.201807779.

(8)   Song, H.; Ma, C.; Liu, P.; You, C.; Lin, J.; Zhu, Z. A Hybrid CO2 Electroreduction System Mediated by Enzyme-Cofactor Conjugates Coupled with Cu Nanoparticle-Catalyzed Cofactor Regeneration. J. CO2 Util. 2019, 34 (August), 568–575. https://doi.org/10.1016/j.jcou.2019.08.007.

(9)   Cao, L.; Liu, P.; Yang, P.; Gao, Q.; Li, H.; Sun, Y.; Zhu, L.; Lin, J.; Su, D.; Rao, Z.; Wang, X. Structural Basis for Neutralization of Hepatitis A Virus Informs a Rational Design of Highly Potent Inhibitors. PLoS Biol. 2019, 17 (4), 1–20. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3000229.

(10)  Liu, P.; Zhao, Y.; Liu, X.; Sun, J.; Xu, D.; Li, Y.; Li, Q.; Wang, L.; Yang, S.; Fan, C.; Lin, J. Charge Neutralization Drives the Shape Reconfiguration of DNA Nanotubes. Angew. Chemie - Int. Ed. 2018, 57 (19), 5418–5422. https://doi.org/10.1002/anie.201801498.

(11)  Meng, H.; Liu, P.; Sun, H.; Cai, Z.; Zhou, J.; Lin, J.; Li, Y. Engineering a D-Lactate Dehydrogenase That Can Super-Efficiently Utilize NADPH and NADH as Cofactors. Sci. Rep. 2016, 6 (April), 1–8. https://doi.org/10.1038/srep24887.

(12)  Han, L.; Liu, P.; Sun, J.; Wu, Y.; Zhang, Y.; Chen, W.; Lin, J.; Wang, Q.; Ma, Y. Engineering Catechol 1, 2-Dioxygenase by Design for Improving the Performance of the Cis, Cis-Muconic Acid Synthetic Pathway in Escherichia Coli. Sci. Rep. 2015, 5 (February), 1–11. https://doi.org/10.1038/srep13435.