副研究员/高级工程师
徐自祥

徐自祥


  • 职  称:副研究员
  • 学  历:博士研究生
  • 通讯地址:天津空港经济区西七道32号
  • 电  话:022-84861965
  • 邮政编码:300308
  • 电子邮件:xu_zx@tib.cas.cn
  • 部  门:生物催化反应机理及应用研究组

简历

2009年起就职于中国科学院天津工业生物技术研究所,助理研究员、副研究员。

2009年博士后出站于东南大学,吴健雄实验室,生物信息学方向。

2006年博士毕业于西北工业大学,电子信息学院,系统工程专业。

2001年硕士毕业于江苏大学,理学院,计算力学专业。

1995年本科毕业于合肥师范学院,物理系,物理专业。

研究方向

研究方向定位于计算生物学,具有交叉学科的知识结构,致力于将数学方法和计算技术结合应用到生物学领域,以干助湿为生物学实验提供指导。总体方向是工业微生物的计算机辅助设计,具体研究方向包括:

1)智能与数值计算方法:计算数学、人工智能、大数据技术等。

2)计算生物学(化学与生物信息学方向):计算蛋白质科学、工业酶设计。

3)计算生物学(系统与合成生物学方向):组学大数据分析、细胞工厂设计。

获奖及荣誉

2001年,硕士学位论文“结构拓扑优化研究与应用”获江苏大学优秀硕士学位论文。

代表成果

目前以第一作者发表计算生物学和应用数学方面中英文论文近30篇,连同合作论文近50篇。

1. Xu Zixiang, et.al.. In Silico Genome- Scale Reconstruction and Analysis of the Shewanella loihica PV-4 Metabolic Network. Journal of Biological Systems. 2018,

26(3): 373–397

2. Xu Zixiang, et.al.. Find_tfSBP: find thermodynamics feasible and smallest balanced pathways with high yield from large-scale metabolic network. Scientific

Reports. 2017, 7:17334

3. Xu Zixiang, et.al.. ReacKnock: identifying reaction deletion strategies for microbial strain optimization based on genome-scale metabolic network.  PLoS ONE .  2013, 8(12): e72150.

4. Xu Zixiang, et.al.. Reconstruction of whole cell network and design of cell factory.  Progress in Biochemistry and Biophysics.  2014,41(2):105~114.

5.  Xu Zixiang, et.al.. Genome-Scale Analysis to the Impact of Gene deletion on the Metabolism of E. coli: Constraint-Based Simulation Approach. BMC  Bioinformatics. 2009, 10 (Suppl 1): S62.

6. Xu ZiXiang, et.al.. Numerical Method Based On Hamilton System And Symplectic Algorithm To Differential Games. Applied Mathematics And Mechanics (Eng Ed).  2006,27(3):341-346.