3. 12个齿轮，象征12个时辰。寓意一：夙夜匪懈、自强不息。寓意二：四维八德。寓意三： 2012年揭牌成立。

4. 基因片断的碱基共40条。其中，末端半圆月形的11条，末端凸的29条，寓意11月29日，与12个齿轮、蓝白两个大圈共同表示出揭牌成立日，即2012年11月29日。

5. 两个基因片段交叉，形成丁香花形，寓意友谊、真诚，表示中国科学院与天津市人民政府共建科研机构。丁香花也象征美丽、纯洁、芬芳、低调，倡导研究所的文化是“只追求价值，不追求赞美”。

6. 四个花瓣，表示研究所“科学研究”“技术创新”“研究生教育”“产业促进”四位一体。

7. 中心点，表示研究所“创新价值、团结求是”的核心理念与“顶层设计、学术自由”的科技组织原则。

8. 内圈、基因片段及中点，寓意细胞文化。